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蛋白胨研究編排對細(xì)胞自身穩(wěn)定的重要性

　　對于人類生物學(xué)與疾病來說，了解RNA結(jié)合

　　在剪接過程中，不典型地編碼蛋白質(zhì)的片段稱為內(nèi)含子，從基因轉(zhuǎn)錄中被刪除，其余序列稱為外顯子，被重新連接。結(jié)合RNA的蛋白胨對剪接過程的控制很重要，它們結(jié)合的位置決定著RNA的哪一段在zui后的基因轉(zhuǎn)錄中被留下或刪除，在模式上與改變影片中情節(jié)的移除和插入場景，或?yàn)榧糨嬒嗤?/p>

　　通過整合關(guān)于這些關(guān)鍵結(jié)合蛋白胨的大量信息，并廣泛應(yīng)用這些數(shù)據(jù)，這將給建立剪接預(yù)測模型和將來如胚胎干細(xì)胞一樣的其他細(xì)胞研究提供基礎(chǔ)。如果能了解這些蛋白如何一起發(fā)揮作用并相互影響來調(diào)節(jié)可變剪接，將為合理設(shè)計(jì)藥物提供重要的線索。

　　此項(xiàng)研究所強(qiáng)調(diào)的那些數(shù)據(jù)繪制出人類細(xì)胞中6個(gè)主要的核不均一核糖核蛋白胨(hnRNP)的功能性結(jié)合位點(diǎn)，這些數(shù)據(jù)通過全基因組方法獲得，其中全基因組方法包括定制的剪接敏感芯片、確定全基因組結(jié)合位點(diǎn)(CLIP-seq)的RNA測序和高通量測序。

　　已確定了這些hnRNP蛋白的數(shù)千計(jì)結(jié)合位點(diǎn)和可變剪接事件，這些蛋白令人驚訝地互相結(jié)合并互相調(diào)節(jié)，其他RNA結(jié)合蛋白胨的整個(gè)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)表明這些蛋白對于細(xì)胞的自身穩(wěn)定很重要。

　　在這項(xiàng)研究中，被RNA結(jié)合蛋白特異靶向的基因也經(jīng)常涉及癌癥。數(shù)以千計(jì)的遺傳突變出現(xiàn)在癌癥中，它們大部分出現(xiàn)在剪接期間被移除的內(nèi)含子里面；但是，內(nèi)含子區(qū)域是調(diào)節(jié)性hnRNP蛋白通常結(jié)合的位置所在。

　　這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)表明了hnRNP蛋白間復(fù)雜且互為補(bǔ)充關(guān)系的一種的深度和它們的可能賦于細(xì)胞強(qiáng)壯的剪接目標(biāo)。RNA結(jié)合蛋白胨的編排不僅對細(xì)胞自身穩(wěn)定很重要，也通過繪制基因上結(jié)合位點(diǎn)與所有調(diào)節(jié)區(qū)域的位置揭示這一過程的瓦解如何引起疾病，也可能是一種干預(yù)途徑。